在孤儿院成长到13岁的时候葛奴乙被卖到了皮革厂，终日与肮脏恶臭为伍，从小就过着与世隔绝的日子的他每日所想的就是怎样保存香气。一次他帮皮革厂主去镇上送羊皮，在大街上他突然闻到了从未闻过的最好闻的味道，他跟着味道痴迷的走着，前面却是一个卖李子的女孩。
他痴迷的跟在女孩子的身后，不停的用鼻子闻她身上散发出来的少女特有的香味，他闻的是那么的痴迷和陶醉，可女孩却被吓坏了，以为他是一个坏人，急忙逃回了自己贫困的的家中，葛奴乙自小在孤儿院长大，又在皮革厂做工，从来没有接触过社会，也没有人与他交流，他跟本不知道自己这么做会给别人带来什么。
他灵敏的嗅觉带领着他找到了卖李子女孩的家，偷偷的站在女孩子身后忘情的闻着，女孩子慢慢的感觉到了自己身后有人，回头一看又是他，恐惧使得女孩子想要大喊，这也怪不得女孩子，任谁见到一个脏兮兮神经兮兮，身上臭臭的男子总是偷偷的跟着自己都会喊叫。
葛奴乙怕被别人发现，慌张的捂住了女孩的嘴，使得女孩子窒息而死，到了现在葛奴乙仍然不知道自己做了什么，他解开少女身上的纽扣，迷恋的闻着她身上的气味，这气味是那么的另人陶醉，那么的好闻，是他从来没闻到过最好闻的味道，
他用双手不停的在少女身上抓，想要留住这美妙的气味，可气味随着风，随着空气一点点的消失，不管他多么的努力，气味还是留不下半点。葛奴乙慌乱了，并不是因为少女的死，而是他发现香味渐渐散去，再也抓不回来了，那天晚上他开始思索，想要找出保留少女身上气味的方法。
一次他帮皮革厂主去镇上送羊皮而结识了一个来自意大利的香水制造商，香水商后来成为他的老师。他终于找到了自己的归属。他凭借自己天生的灵敏嗅觉几分钟就配置出了老师一直梦寐以求的香水并且经过自己的改进使得香水趋于完美。就这样他走上了香水制作的路。
老师告诉他一个关于香水的传说，在遥远的古埃及，人们始终认为有一种东西使得香水具有某种神力。后来的人们在挖掘的过程中发现了一个双耳陶瓶，开启之后，据说闻到的人都仿佛进入了天堂，其中的十二种香料都已被人们辨别，只有那神秘的第十三种至今没有人知道它的奥妙，而它却是最重要的。
葛奴乙灵敏的嗅觉和天才的配方给这个意大利香水制造商创造了大量的财富，接着葛奴乙开始跟着他的第一个师傅开始学习提炼香味的办法，4种香氛做前调，瞬间的饕餮，4种香氛做中调，持续几小时的盛宴，4种香氛做后调，持续几天的天籁，再加上一种特殊的香氛，便可以做成世上最完美的香水。
他的师父不遗余力的把自己所会的一切都教给他，可他会的并不多，只教给他用一万朵玫瑰花制作出一盎司精油的蒸馏法。葛奴乙很兴奋以为学会了提取味道的途径，他开始把各种各样的东西都放到蒸馏器里，想要提炼出它们特有的味道，他放了石头，铜，玻璃，甚至一只死猫，可他发现，他蒸馏出来的东西没有一点的味道。
葛奴乙愤怒了以为他师傅欺骗了他，接着他失去了希望病倒在床上，他病的很严重几乎要死去，他师父给他请了许多的大夫都找不出病症，可当他的师父告诉他还有别的方法保留气味的时候，他的病奇迹般的好了，最后他用五百种香水的配方换取了出徒的证明，获得自由，前往香水发源地－普罗旺斯寻找保存气味的方法。
他朝着自己的方向前进，前进的路上他迷路了，这是一座很高的山，他跟着自己的嗅觉找到一处山洞，山洞里气味令他很舒服，他呆了很久，可他突然他发现在他能辨别万物味道的同时，他自己是没有味道的。一种容易被别人忘却和忽视存在的恐惧弥漫开了。存在感、认同感、被认知感……!
葛奴乙慌了，跑到磅礴大雨的外面，拼命的洗着自己的身体，可不管他怎么样洗，他还是闻不到自己身上半点味道，是的，他没有气味，所以她拥有神的鼻子。
葛奴乙来到了制作香水的圣地格拉斯学习制作香水，他要做出那传说种的香水。就这样，他学会了另一种方法——油萃取法。之后，又有了另外一种——油膏吸取法。
他痴迷于少女的幽香，冷静果决的杀死一个又一个少女，在她们死后，割下头发，然后用动物油脂包裹住皮肤，把吸收了她们体味的油脂重新蒸馏，一桩接一桩的谋杀案，完美的杀死一个又一个处子之身的少女，连一滴血都没有遗漏。12个少女的味道被提炼精化后变成12瓶独一无二的精油。最后那一种，来自最迷恋、最美丽的少女。
一瓶又一瓶的少女体香精华被他萃取，最后就差美少女罗拉的一瓶，罗拉的父亲千方百计的保护她，她的美貌也无法打动葛奴乙，他只是拿回自己所需要的。
他成功了，为此他杀害了十三个美丽的少女并从她们身上提炼出芬芳的精油，勾兑出世界上最完美最神奇的香水。同时，他的恐怖行径也败露了，香水完成时也是他被死亡审判的时刻，广场上人头攒动，人们都在等待葛奴乙被酷刑折磨到最后一滴血的场面。众人的愤怒需要葛奴乙的死来平息。葛奴乙并没有一丝的慌乱，以一滴香水点于脖颈，走向刑场，香水的气息飘散空中，甜蜜的、温暖的、纯洁的、来自天堂般的气息。侩子手丢掉刑棒，群众跪拜，连观礼的教皇也双手合十。他将香水洒于白手绢上，抛向空中。人群开始疯狂。
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