所有叙述中只有一点是共同的，就是耶稣已经不在那儿了，但甚至这一点也有疑问。《约翰福音》中，抹大拉转过身来发现耶稣站在墓园里。她向他走去，但耶稣阻止了她的拥抱，说，“不要拥抱我”（《约翰福音》）。
这四篇福音书是整个耶稣复活教义存在的基础，但它们几乎在每个细节上都不一致。正由于此，千百年来人们一直在争论耶稣复活后第一个见到他的是玛利亚·抹大拉还是彼得。就算福音书所有的描述中有一种是正确的，现在已经不可能知道到底是哪种。事实上这也并不重要，因为未入选《新约》的《彼得福音》和《玛利亚·抹大拉福音》都提到抹大拉是第一个见到复活后的耶稣的人，这一荣誉当然应该是属于她的。
《腓力福音》中说“有三人常伴在主左右…他的妹妹、他的母亲和他的配偶，她们都是玛利亚”.这三个人一起出现在十字架旁，也许还一起出现在坟前。《腓力福音》中还提到，“救世主的配偶（Consort）是玛利亚·抹大拉”.（从严格意义上来说，耶稣的每个妹妹都应该是拥有“玛利亚”头衔的）
揭示玛利亚·抹大拉身份的关键就在于原版福音书的一个希腊词，英文版正是根据它翻译过来的。在字典的释意中，“Consort”是指“王室成员的配偶，共同拥有头衔”.这个词在意思上决无歧义，它特指正式婚姻中的性伴侣。
出现在耶稣坟前的女人到底是一个、两个还是三个，这给罗马教会造成了很大困扰，因为它自称为圣彼得创立的使徒教会。于是在4世纪，《马可福音》后面被加上了伪造的12节。对观福音书中的《马太福音》和《路加福音》都被做了增补。
通过这种手段，玛利亚·抹大拉的地位一落千丈，她的后代和他们坚持的拿撒勒教派也渐渐被人们淡忘。主教们一手遮天制定的策略抹煞了女性在基督教中的地位。《使徒宪典》和《教会惩戒律》就是为达到这一目的而推出的。
挑选福音书的标准是什么？
《新约》挑选工作是于公元367年开始的，当时有大量作品被审察比较，以待挑选。最初的工作是由亚历山大主教阿他那修承担的，他发明了“正经”一词，后来被人称为“纯正信仰之父”.在此之前，世界上不存在经过正式汇编的信仰书，只有一些独立的基督教经文散落在罗马帝国各地，有些流传甚广，有些鲜为人知。
在经过阿他那修挑选的清单中，一些经文于公元393年在希波大公会议经核准采用，另一些于公元397年在迦太基大公会议上通过。然而，左右《新约》挑选的标准有很多，第一条就是能入选《新约》的福音书必须是耶稣的使徒写的，或者是以他们的名义写的。但从一开始这条标准就被忽视了，出现在《新约》中的四篇福音书分别是《马太福音》、《马可福音》、《路加福音》和《约翰福音》。
“主教们把经过挑选的福音书呈给君士坦丁大帝（摘自12世纪罗马文件”
根据《新约》中的使徒名单，马太和约翰的确是耶稣的使徒。但马可和路加不是。在《使徒行传》中，他们是后来和圣保罗一起传教的人。从另一方面说，多马、腓力和彼得都是耶稣的十二使徒之一，但他们的福音书却没有入选。不仅如此，教会还宣布必须毁掉他们的福音书。于是在整个地中海地区，人们把这些福音书、《玛利亚福音》以及其他突然被宣布为异端的经文一起掩埋或者藏匿起来。
在此之后，目的性极强的《新约》经过了无数次编辑和修改，直到1547年意大利北部的特兰托大公会议上才最终获得通过，这就是我们现在所熟悉的《新约》。
一些早期文献直到最近才被发现，但这些文献的存在对于宗教历史学家来说并不是秘密。早期传教士亚历山大的克雷芒、里昂的依勒内和圣历山大的俄利根在作品中都引用了其中的内容，例如《多马福音》、《埃及人福音》和《真理的福音》。
挑选福音书的标准是什么时候制订的呢？这是个完全男性至上的标准，它排除了一切抬高女性的教会或者社会地位的文献。罗马教会是圣彼得的使教教会。在《多马福音》中，彼得的观点被描述得非常明确。他强烈反对玛利亚·抹大拉出现在耶稣周围。《多马福音》记录了他对其他使徒说的话：西门彼得对他们说，“让玛利亚走开，女人根本不应该活着”.
而且，其他文献也清楚表现出彼得对抹大拉的厌恶。在《玛利亚福音》中，彼得质疑耶稣和她之间的关系，说：“他真地会私下同一个女人说话，而不是同我们说？为什么我们要改变主意听她的话？”在科普特语的《信仰智能书》中，彼得也抱怨抹大拉参与讨论，请求耶稣不要让她破坏他至高无上的地位。
在一世纪的早期基督教中就出现了两个派别。占主要地位的是耶稣的弟弟雅各领导的拿撒勒派。奋锐党的西门、腓力、多马、达太、犹大、莎尔美、玛利亚·抹大拉以及她和耶稣的后代都属于这一派。另一派是彼得和保罗坚持的福音派（通常被称为“使徒保罗派”），中心在罗马。后来它逐渐转化成“教会教”，而不是原本的基督教。在君士坦丁大帝正式宣布它为国教后，它最终战胜了拿撒勒派。
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