8月12日，从听到风声的三屯、四屯等村子来了许多中国农民。他们小心翼翼地接近731部队设施。过去，这块宽阔的土地用土墙围着，还立有“未经关东军司令许可，严禁入内”的高牌子，一直是危险地区，如今，专制bào君731部队一下子土崩瓦解，这里正在回到原来的有权者中国人的手中。
中国农民们确认安全之后首先进入东乡村宿舍，开始抢家具等什物。如果在几天前发现这种行为，马上就会被枪杀，可是，现在在败退中的部队人员眼里巳激怒不起来了。部队人员在撤退作业中满脸是汗水和煤灰，望着这座正在烧毁中的恶魔之城，身心都巳疲惫不堪。
在烈火中，工兵队员费了很大劲才彻底炸毁了“马鲁太”特设监狱，有的人头部由于火药爆炸时飞散的混凝土块受了重伤。
“要严守部队的秘密！”
在8月11日至15日期间，溃退中的731部队人员和家属乘坐的专用货车，实际上共有15列（每列由20节编成）。
从731部队专用铁路线直接出发的列车，先抵达平房火车站，尔后又同后发列车联接在一起。列车的编组和出发日期多种多样。前边的列车通过沈阳时，后发的列车还停在平房火车站。因此，在原部队人员的记忆中，“退败时的体验”各不相同，很难统一起来。从平房火车站先沿拉宾线北上，在滨江火车站增加第三部诊疗部有关人员乘坐的货车，并在列车最前头、中间和末尾加上三个火车头，专用货车像大黑蛇似地不断地从哈尔滨火车站蜿蜒曲折地向南驶去。关东军总司令部把这一列火车作为带有特别机密的军用列车来对待，在经过的主要车站，都配置了许多宪兵，保证这些列车优先通过。离开火烧得如同白昼般的平房设施，这条大蛇群缓慢地南下了。8月15日傍晚，许多731部队人员和家属在抵达沈阳和长chūn前就听说战争结束了。“听说美军巳在日本登陆，妇女都被qiángjian”，“整个日本国土到处都遭到轰炸，家属们四处逃散”，“长chūn已被苏军占领，开始打巷战了”等等，在天皇发表宣告战争结束的诏书的同时，各种小道消息在火车中传开了。由于驾驶专用列车的中国司机很快逃走，后发的货车在长chūn附近停了一整天，一动也没有动，部队人员把堆在车厢里的大米、大酱、酱油等拿到铁路一旁，并偷偷地潜入中国人的村落，袭击jī窝偷jī，赶做饭菜。
但是，在以妇女为主的家属专用货车中，听到战争结束的消息，在家属中间发生了悲剧。她们感到前途悲观，在小道消息的恐吓下，女文职人员和部队人员的妻子们吃了发给她们的小瓶氰酸化合物而自尽了。还发生了这样一件事：
8月16日晚，“装满”家属的货车在长chūn车站停车时，副官通知各节车厢说：“现在，石井四郎部队长阁下要向大家讲话。”家属们走下车站，在月台上，石井四郎站在他们前面，跟随拿着蜡烛的副官走动着，分别向各节货车的家属们大声讲话。
“……日本战败了，现在即将让你们回国……但是，无论在什么qíng况下，你们都要严守731部队的秘密。如果有人泄露了军事机密，无论讲到什么程度，我石井可要追查泄露机密的人，记住了吧！”在烛光照耀下，石井四郎的表qíng笼罩着一层奇怪的yīn影。在家属们看来，简直是一副yīn气bī人的形象。抱着幼儿的母亲由于魔鬼的突然出现，吓得颤抖起来。
败退的列车群，从安东经新义州，于8月中下旬抵达朝鲜半岛南端的釜山。每到一个车站都遭到中国人和朝鲜人的袭击和掠夺。有的列车上的全体人员是忍受着饥饿和疲劳的折磨抵达釜山的。许多人在列车上丧了命。有的部队人员说：“回到日本也没啥用，不如留在这儿当土匪。”于是就途中下了车。有的人逃得慢，成了苏军或中国八路军的俘虏。随列车的不同撤退时间，各人的体验也不相同。如果把731部队人员和家属撤退回国和在收容所经历的苦难生活都写出来，仅这一部分就可以写成一部厚厚的纪实。运输731部队人员回国的轮船，在1945年8月18日至25日期间，先后抵达佐世保、博多、舞鹤、敦贺、门司、仙崎（山口县）和萩等港口。
“告全体部队人员：……希望诸位严守以下三条：（一）回到故乡后，也要隐瞒曾参加过731部队的事实，要隐瞒部队的经历；（二）不就任一切公职；（三）严禁部队人员之间相互进行联系。”
这是回国轮船抵达码头时向731部队人员下达的命令。那时下达的这条命令，在战后十多年中间一直束缚着原部队人员。在原部队文职人员中，有的人由于隐瞒部队经历，不能申请旧军人抚恤金，在贫穷的生活中结束了自己的一生。
少年兵们等待着接受严峻的人生航道。撤退时他们只有14岁到18岁，但是不承认他们具备国民学校高等科毕业以上的学历，利用掌握的临chuáng检查技术谋生并非一件容易的事qíng。在战败的混乱时期内，少年兵作为日本陆军的私生子尝尽了一切辛酸。
在原少年兵中，掀起了要求承认他们的见习技术员学历资格的运动。但是，以石井四郎为首的731部队的gān部们害怕涉及自己的战争犯罪，对于原少年兵们战后的困境釆取了视而不见的态度。没有一个人愿意把在731部队内接受高深教育的实际状况向文部省人士进行说明。少年兵成了连在731部队中呆过都得不到“承认”的私生子。尽管在动员时宣传过，但是在石井四郎的脑海里根本没有让少年兵获取正式资格的想法。
据传，石井四郎战后初期一直在东京新宿区若松町利用未烧毁的一幢与陆军有关的建筑经营旅馆，当时美国占领军曾传询过他，那是1945年冬天的事。远东国际军事法庭开庭时，苏联要求审问和惩办满洲731部队石井四郎部队长等领导人。但是，石井四郎立即向“盟军”总司令部献媚，把秘密带回国内的731部队的有关资料提供给美军，以图保全自己。
美军当局得到大量当时世界上最新的细菌战资料狂喜万分，把一直关押在中国上海俘虏收容所中的北野政次（1942-1945年期间曾任731部队部队长）悄悄地放回了日本。“盟军”总司令部审讯石井四郎前，石井和北野在日本某地进行了秘密会谈。这是美军当局给予的一种旨在掩盖罪行的“温qíng”，使石井和北野获得了利用一整天的时间jiāo换qíng报和进行商谈的机会。统一口径，严守应该保密的事项，为即将进行的审讯做了准备。结果，“盟军”总司令部当局的审讯仅仅是一个形式，“石井四郎等人下落不明，731部队不足成为战犯”。他们将这一见解转告苏联方面。731部队进行过世界史上前所未有的细菌战，并杀害、“消费”了3000多人，但却几乎丝毫无损地继续生存于战后的日本。此后，石井四郎在东京四谷地区从美军手中弄到一间与原海军有关的宿舍，把它改造成为美国兵的慰安设施（jì院），一边让女人们卖yín，一边整理从平房带回来的有关731部队的资料。
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