第二种观点，是认为科学与宗教各守各界，互不相干。科学不能越界来解释人生意义，善恶美丑一类问题，而宗教也不能越界解释自然规律。它们满足人类的不同需要，不可或缺。
持这种观点的人，多认为在历史上与科学对抗的，不是“真正的宗教”，而是体制化的，拥有既得利益的宗教机构和神职人员。他们喜欢举的一个例子就是，新教国家的科技水平普遍高于天主教国家，因为新教更提倡自由思想。再比如，在普通教育里取消“创世论”，改教“进化论”，意味着一大批神学教师要面临失业。这些具体利益的冲突才是科学与宗教冲突的背景，而从纯精神领域来说，科学与宗教并不冲突。
今天，除了极少数宗教国家外，当今世界所有现代国家在制定有关政策时都遵守这一前提。
第三种观点，则认为科学与宗教是互补的关系。比如，西方最初的一大批早期科学家都是在宗教精神的感召下研究自然的。他们认为，自然是上帝创造的又一部《圣经》，而研究自然正是在阅读这本《圣经》。象牛顿、伽利略、哈维这样的科学家，每当他们揭示出某种自然规律时，总会深深地感受到造物主的神奇。他们所创作的科学著作，经常围绕某些宗教教义展开，并且使用大量宗教术语。
即使在今天，在科学界里已经彻底排除宗教影响的情况下，最尖端的科学研究仍然是产成类似宗教情怀的沃土。宗教感情产生的重要基础，就是面对宏伟、神秘的大自然产生的敬畏感。科学发展确实起到了破除这种敬畏感的作用，但那往往只是针对普通大众。不从事科学研究的人们，面对的自然现象非常有限。人们不需要知道宇宙的尺度，或者恐龙在什么环境下生活。而常识涉及的有限自然现象，又差不多都能够找到确切的科学解释。人们知道喝生水得病是由于水里有病菌，知道天下雨是大气中的水气凝结，诸如此类的科学常识，加上围绕着我们的先进技术，足以令人们摆脱因果报应观念，获得对周围环境的把握感、力量感。
但是，那些要面对宇宙大爆炸、热力学第二定律，或者海森堡测不准原理的职业科学家，很难不在远比日常生活宏大和深远的领域里，重新获得对自然世界的敬畏感。
科学与宗教的复杂关系也折射到科幻作品里。不同的科幻作品以不同态度来对待这一关系，笔者大致把这些倾向分为以下四类，并分别选择代表作品来介绍。
第六卷：科幻与科学 第二章：科学VS宗教（2）
第二节：对象化处理
所谓对象化处理，就是把宗教当成现实生活的一个客观组成部分，和政治、军事、经济、文化等并列。作者既不倾向它也不加以反对，仅仅把它当成虚拟世界的组成部分。采取这种态度的作品，有的是直接描写现实中存在的宗教，有的则自创教派。这种倾向最突出的例子，就是《星球大战》系列里的“杰迪武士”。
杰迪武士完全是以宗教苦修团体为摹本塑造出来的。他们不蓄私产，一切自由交给团体支配，生活简朴，严禁婚恋，并且有类似“童子功”的严酷要求。他们信仰一种叫“力”的神秘力量。尽管故事里展示的科学技术十分发达，人们能够在星际间朝发夕至，但却始终没有搞明白“力”的本质是什么。当然，这种不明不白正是这个电影系列宗教色彩的出发点。
按照杰迪武士团的说法，万物从“力”中来，将来要复归于“力”。杰迪武士如果能练到与“力”合为一体，便会拥有类似特异功能的本领：预言未来、隔空取物、激发身体潜能，等等。
与正义的杰迪武士相对，还有一批邪恶的“西斯武士”。他们最早是从杰迪武士里面分裂出去的，从此代代与杰迪武士为敌，引诱他们堕入“力的黑暗面”。在杰迪武士团里流传着一个“大预言”，声称将来杰迪传统要沦入短暂的黑暗时代，而一个伟大的武士会力挽狂澜。后来，这个预言应在“天行者阿纳金”身上。他的母亲从未与男人接触就怀上了他，自幼便显示了种种神迹。
可以说，如果把《星球大战》改名为《堕落与救赎》，似乎更能反映它的主题。当然，这可能在票房上会导致巨大损失。卢卡斯虚构了“杰迪武士”这么一种“准宗教”，令《星球大战》故事完全有别于传统的“太空剧”，可谓另辟蹊径。
熟悉宗教的朋友一看遍知，这整个宗教体系都是参考基督教教义构建的。惟一不同的是，这里的“耶稣”受了“魔鬼”的诱惑，为非作歹许多年后，才通过自己的儿子获得了“救赎”。当然，作者建造这么一套“力”的宗教，并非为了宣传宗教思想，其目的只是使故事更曲折、更丰富，更富于神秘主义韵味。
这几年掀起热潮的《黑客帝国》被许多人称为哲学电影，但笔者觉得它更有宗教色彩：尼奥便是典型的救世主，从一个普通人，突然获得种种神通，能够救众生出虚拟世界。而其中因爱获救，洞悉世界本原的场面，更有一些东方宗教的风格。
最有趣的是，作为这个救世主对立面的“主体”，很象是十六、十七世纪某些基督教学者描述的上帝：它形成万事万物，存在于万事万物中间。据说当年，大科学家牛顿就认为上帝每时每刻在他身边监视着他，令其诚慌诚恐。而在《黑客帝国》里，“救世主”和“主”，“圣父”和“圣子”竟然不是一条心，似乎可以代表着几百年来，某种思想感情的变化。
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