于是埃齐奥开始搜寻和抹除萨佛纳罗拉的支持者，他们也的确来自各行各业——其中有一位著名画家、一名老兵、一个商人、几位牧师、一个医生、一个农夫，还有一两个贵族，他们都是那位修士的狂热支持者。有些人在死前明白了自己的愚蠢，有些人的信仰却毫不动摇。除了任务本身令埃齐奥不快以外，他也时常面临死亡的威胁。但很快，谣言就开始在这座城市里流传——在夜深人静之时，在非法酒馆和后街小巷里。刺客回来了。刺客将会拯救佛罗伦萨……
埃齐奥看着自己出生的城市遭受宗教狂热的憎恨与疯狂的荼毒，不禁心如刀绞。他硬着心肠为那些人带去死亡——就像一股冰冷的风，吹走了那些让这座城市风光不再的渣滓。他在杀戮时一如既往地带着怜悯，心里知道对这些早已偏离正道的人来说，这是唯一的结局。即使在这样黑暗的时刻，他也从未偏离过作为刺客的信条。
在这座城市里，公众的立场发生了变化，萨佛纳罗拉明白自己的地位正在动摇。而马基雅维利、狐狸、葆拉和埃齐奥联起手来，开始组织一场起义，一场由人们缓慢却不可阻挡的领悟所指引的起义。
埃齐奥的最后一个“目标”是位牧师，埃齐奥找到他的时候，他正在圣灵教堂前向一群人布道。
他慷慨陈词，但本就稀疏的人群渐渐失去了兴趣，很快最后几人也转身离去。埃齐奥走上前，对那牧师说：“你刚才那番话，我觉得那是你自己的想法。”
那牧师大笑起来。“我们并不全都需要劝说或者胁迫才会信服。我已经相信了。我所说的一切都是真理!”
“万事皆虚。”埃齐奥答道。他弹出腕刃，刺穿了那牧师的身体。“安息吧。”他说。他转身背对着死者，戴上了兜帽。
这段路漫长而又艰辛，但到了最后，萨佛纳罗拉本人也在不知情下帮了刺客们一把，因为佛罗伦萨的财力出现了严重衰退。这并不奇怪，那位修士痛恨一切商业活动，而商业正是让佛罗伦萨强大的原因。而且最后审判仍未到来。反而有位方济各会修士对萨佛纳罗拉做出了火之审判[1]的挑战。但萨佛纳罗拉拒绝了挑战，他的权威也再次受到了重创。到了1497年3月初，城市里的许多年轻人开始游行抗议，抗议又演变成了暴乱。在那之后，酒馆重新开业，人们恢复了从前唱歌跳舞、赌博嫖妓的习惯——开始享受生活。店铺和银行也纷纷开张，尽管起初数量不多;遭到流放的人也回到了城市里不再受萨佛纳罗拉控制的区域。这些并不是一夜之间的变化，不过到了最后，在那场暴乱的大约一年之后，尽管萨佛纳罗拉仍在苦苦支撑，但他垮台的时刻看起来已经不远了。
“你做得很好，埃齐奥。”葆拉对埃齐奥说。他们正和狐狸以及马基雅维利一起，等在圣马可修道院的大门口，身后是一大群来自各个自由区域，满心期待却难以驾驭的民众。
“谢谢。可现在该做什么?”
“看着就好。”马基雅维利说。
随着响亮的碰撞声，他们头顶的一扇门打开了，有个身着黑衣的瘦削身影出现在阳台上。萨佛纳罗拉怒视着聚集在下方的民众。“安静!”他命令道，“我要你们安静!”
在敬畏中，人们不由自主地安静下来。
“你们为何来此?”萨佛纳罗拉质问道，“你们为何打扰我?你们本该清洁自己的住所!”
人们却大吼着反对。“清洁什么?”有个男人喊道，“你把所有东西都拿走了!”
“我已经手下留情了!”萨佛纳罗拉大喊着回答，“现在你们要照我的吩咐去做!你们必须服从!”
他从衣袍里取出伊甸苹果，高高举起。埃齐奥看到那只手少了一根手指。那只苹果立刻开始发光，人们惊呼着纷纷后退。但埃齐奥仍然保持着镇定，他站稳脚跟，毫不犹豫地掷出一把飞刀，贯穿了那修士的前臂。萨佛纳罗拉发出愤怒而痛苦的叫声，放开了那只苹果，后者从阳台掉到了下方的人群里。
“不……”他尖叫道。但突然之间，他仿佛缩小了，他的举止变得既笨拙又可悲。这对暴民们来说已经足够了。他们集结起来，冲进了圣马可修道院。
“快点，埃齐奥，”狐狸说，“找到那只苹果。它应该就在不远处。”
埃齐奥看到它正在人们的脚边滚动，却没人低头看它一眼。他冲进人群里，被重重地推挤了好几下，但最后还是拾起了苹果。他迅速将伊甸苹果放进安全的腰包里。圣马可修道院的大门已经打开——也许是修道院里的某些修士相信“谨慎即大勇”的说法，希望通过向无可避免的结果屈服来保全他们的教堂和修道院，当然还有他们自己的性命。而且他们之中也有不少人受够了萨佛纳罗拉的暴政。人们涌入大门，又在几分钟后再次涌出，身上抬着挣扎嘶喊的萨佛纳罗拉。
“带他到领主广场去，”马基雅维利下令道，“让他在那里受审!”
“白痴!亵渎者!”萨佛纳罗拉喊道，“上帝将会见证你们的亵渎之举!你们怎敢如此对待他的先知!”他的一部分话声被人群愤怒的呼喊淹没过去，但他的恐惧和愤怒同样强烈，因此他没有停止咒骂——因为萨佛纳罗拉知道(虽然他想到的肯定多半不是这几个字)他除了孤注一掷以外别无他法了。“异端!你们都会因此在地狱里被烈火焚烧!你们听见了吗?焚烧!”
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