海关关员也希望是这样，很希望货柜是正常的，这样所有的人都比较省力，但行动一定要切实地执行起来，以配合海关的专项行动。事情通常就是不如意的。打开第一个货柜，他们闻到了一股刺鼻的硝酸铵味，原来里面装满了尿素;打开第二个货柜，里面则装满了密密麻麻的钢管;打开第三个货柜，白花花的大米“哗”的一下，撒了一地。
就这3个有着完美报关单的家具出口货柜竟然没有一个里面是真正的家具，而是化肥、钢材、粮食，而这几种货物都是国家限制出口的资源性物资，需要取得出口许可证件，并交纳一定的关税之后才出口的。这3个货柜的严重违规行为是：伪报!逃证!逃税!
鉴于这种情况，25日晚上海关对涉案3家企业的报关数据进行了翻查，发现他们还有4个货柜尚未出港，申报货物的名称仍然是“家具”。 海关关员立即打开货柜查验，里面都是没有任何伪装的面粉。
就在查验这4个货柜的时候，一个比较细心的查验关员发现货柜旁边的两个货柜在颜色、新旧程度、船公司标识上都十分相似，那这些货柜是不是也有问题呢?海关关员决定当场打开查验，结果仍是令人吃惊的，货柜里都是没有任何伪装的面粉。
出于事情的重大性，情况很快就上报至关长那里，关长很快就做出了决断：“这些现象显示，走私的货柜肯定还有很多，查!一定要查到底!所有未出港的货柜未经海关同意不得离港，所有的海关人员要进行地毯式的搜查!”
广州南沙港每天有上万个货柜进出，码头面积超过3平方公里，上面堆放着超过十万的货柜，如果逐个开柜查验，三个月也不一定能查得完，但海关关员们一定要与时间赛跑。
他们首先把目标放在即将离港的船只上，将装船舱单逐项审核，发现其中的22个货柜嫌疑比较大，于是立即紧急叫停即将离港的远洋巨轮，从舱底翻查出可疑的货柜，经核实，有13个是伪报走私货柜。
在展开查验的同时，海关还调取了电子申报数据，进行风险参数的分析，结果显示，可疑货柜都具有一些特征：申报为家具等低风险物品、单证数据逻辑合理、由穗海南沙公司报关等，这让海关排查的包围圈越缩越小，并利用这些特征逐步锁定了200多个可疑货柜。
从15日案发至28日，海关集中兵力，港务公司调动全部作业车辆和吊机，两方面相互配合之下，昼夜地毯式排查，连续作战，采用3班倒轮番查验的方式，查获了涉嫌走私出口的资源性物资178柜，其中面粉108柜、大米56柜、尿素10柜、钢材4柜，查获粮食近4000吨。
这是迄今为止广州海关个案查扣货柜数量最多的案件，178个货柜堆在一起，相当于一幢占地300平方米的五层楼房。
而经过调查，涉案的企业两个月一共走私出口的资源性物资达643个货柜，违法出口了超过重达12000吨的货物，其中走私的粮食涉及大米、面粉等，数量高达8000吨，以每人每月10公斤计算，已经有相当于80万人口1个月的口粮被走私到国外。
疑犯相继被抓，案子终于告破
2008年7月25日，海关关员在对在港货柜进行查验的时候，给穗海南沙的肖兴文打过电话，说明了情况，要求他到场配合工作。肖兴文没想到这样的事情发生，但他还是显得比较镇定的，他先是应付海关说：“我一定配合你们的工作，但我现在手头还有事情，等忙完了，我会去海关配合工作的。”
挂断电话后，肖兴文立刻就回到了公司，让方永强带着自己的电脑和各种单证找个地方躲一躲，然后给员工们放了大假，并告诉他们不要再联系公司，到时候公司会联系他们的。肖兴文这样做抱有一定的侥幸心理，他认为，只要没有证据，那三个货柜是不会连累其他货柜的。
肖兴文一直忙活到晚上9点，一直到接到“物证已转移”的电话之后，才前往海关。海关的人员对他进行了一番询问，肖兴文一方面是出于害怕，一方面是为了避免出错而刻意地掩饰，他的回答支支吾吾，甚至有些是前后矛盾的。他的行为让海关的人非常怀疑。缉私局的人很快就到了肖兴文的办公室进行搜查，但什么有价值的东西也没有发现，肖兴文心里暗自高兴。缉私局和海关的人只能将其暂时扣押。
7月26日上午，在南沙码头查验的海关官员传来消息，中艺南沙也与这次的走私粮食案件有关，于是缉私警察迅速前往负责人何冰在南沙新垦的住所进行查询。何冰没来得及将证物转移走，被缉私警察逮了个正着。
由于何冰、肖兴文等人的关系千丝万缕，缉私警察们顺藤摸瓜找到了穗海南沙的员工宿舍，而更巧合的是，肖兴文的员工将他的电脑和单证全都藏在了员工宿舍二楼的夹层之中。经过仔细的搜索，缉私警察在夹层中将电脑和单证全部查获。这样，何冰和肖兴文就跑不掉了，有足够的证据能够证明他们的走私罪了。
在很短的时间内，汪华松等人策划和参与走私案的犯罪嫌疑人相继被抓。
而走私粮食的始作俑者杨守中怎样了呢?在肖兴文接到海关的电话之后，他就打电话告诉了杨守中，杨守中立刻就将证据要么销毁，要么藏起来。过了几天后，他发现缉私警察一直没有出现，就很侥幸地与王鹏、何树铭在广州黄埔一茶馆见面，但他不知道自己早就被列为了侦查对象，一直不抓捕他，是想利用他引出更多的团伙分子。
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