在公元61年耶稣去马耳他之后，追寻他的踪迹就比较困难了。有些文献表明他跟随使徒多马的脚步去了印度，后来在克什米尔的斯利那加去世，那里有一座他的坟墓。但这一结论的基础是1894年克什米尔人的一份声明，声明中说耶稣和先知YuzaAsaf是同一个人，这座坟墓就是他的。虽然这一声明引起了人们的兴趣，但证据并不充分（见附录III）。但是，耶稣显然是死于公元73年或者之前。因为在那一年，他的长子耶稣贾斯特斯被加冕为王：“我耶稣差遣我的使者为众教会将这些事向你们证明。我是大卫的根，又是他的后裔。我是明亮的晨星”（《启示录》）。
神父和传教士通常会说《新约·启示录》中连续提到的婚礼是象征着耶稣基督和基督教会的密切结合。但事实上，当圣约翰（使徒约翰·半尼其）在希腊的拔摩岛上写下神秘的《启示录》时，教会还没有成立。他根本就不知道在他死后会有这样一个组织迅速发展。他在深奥的作品中记叙的婚礼其实是对救世主家庭历史的记载。
耶稣和玛利亚·抹大拉的女儿他玛于公元53年在雅典嫁给了圣保罗。耶稣贾斯特斯的婚礼就是《启示录》第19章中描述的羔羊的婚礼。正如约翰把耶稣称为“神的道”一样（《约翰福音》），约翰·半尼其把他称为“神的羔羊”（《约翰福音》）。这些比喻——道和羔羊，在《启示录》中也同样被用在耶稣的后代身上。
耶稣贾斯特斯（生于公元37年）在公元73年时年满36岁，他的新娘在婚礼晚宴上“蒙恩穿上光明洁白的细麻衣”，“他说…我和你，并你那些为耶稣作见证的弟兄同是作仆人的…他的名称为神之道”（《启示录》）。
他的儿子耶稣三世生于公元77年，后来成为了阿拉法和俄梅戛（《启示录》）。这是希律王室的撒都该教派的头衔，当希律王室于公元102年终结时，这一头衔转由大卫王室继承。耶稣三世于公元113年结婚（按照王室传统，那时他也是36岁），他宣布，“我是大卫的根，又是他的后裔。我是明亮的晨星”（《启示录》）
耶稣最爱的门徒究竟是谁？
“耶稣所爱的门徒”是个神秘人物，他的身份已经被争论了上千年。大多数人认为他是指使徒约翰·半尼其，西庇太的儿子，雅各的兄弟。另一个有可能的人当然是玛利亚·抹大拉，因为《新约》的福音书和《腓力福音》都提到过耶稣爱她。第三名候选人是约翰·马可，或者被称为圣马可。
在《新约》中，《约翰福音》是惟一提到这位蒙圣宠的门徒的。在描述耶稣受难的章节中，有一节提到耶稣指定这位蒙圣宠的门徒作为圣母的保护者。这段资料立刻把玛利亚·抹大拉排除在外，因为很明显这个门徒是男性：
耶稣见母亲和他所爱的那门徒站在旁边，就对他母亲说，母亲，把他当成你的儿子…从此那门徒就接她到自己家里去了（《约翰福音》）。
除了《约翰福音》中提到的这个“被爱的门徒”外，只有耶稣的女性亲威陪伴在他受难的十字架前。所有福音书中都是这样记载的。这里没有提到彼得或者任何使徒到场。在耶稣受难前，《马太福音》第26章和《马可福音》第14章中都说到，在耶稣被捕后，使徒们都离开他逃走了。很明显，没有任何人留下。
这个神秘的门徒后来又出现在耶稣复活的场景中，这再次排除了玛利亚·抹大拉，因为她和这个门徒有对话。而且我们也可以排除彼得，因为他的名字已经被列出来了：
她就跑来见西门彼得和耶稣所爱的那个门徒，对他们说，有人把主从坟墓里挪了去，我们不知道放在哪里。（《约翰福音》）
后来，在彼得和耶稣的谈话中，又提到了两次“耶稣所爱的门徒”，但没有说出他的名字。约翰·马可也可以被排除了，因为福音书中第一次提到这个神秘人的时候，他正和耶稣一起吃最后的晚餐：“有一个门徒，是耶稣所爱的，侧身挨近耶稣的怀里”.（《约翰福音》）
虽然《约翰福音》没有特别说明最后的晚餐桌上有谁，但其他三篇福音书都提到了，而且它们一致说明最后的晚餐只有耶稣和他的十二使徒参加了：
到了晚上，耶稣和十二个门徒坐席。（《马太福音》）
到了晚上，耶稣和十二个门徒都来了。（《马可福音》）
耶稣坐席，十二使徒也和他同坐。（《路加福音》）
由于所有福音书都没有把约翰·马可（第一次出现是在《使徒行传》中）列为十二使徒中的一个，他肯定没有参加最后的晚餐，因此也不可能是侧身挨近耶稣怀里的人。这三个候选人只剩下约翰·半尼其了，这也是大多数人认定是他的原因。但问题是，《约翰福音》的作者不太可能给这么重要的人物留下一个不明确的身份。
在所有福音书中，《约翰福音》是最明确的。它叙述了许多其他福音书中没有提到的重要事件，例如迦南的婚礼和拉撒路的复活。它是惟一一篇说明在贝瑟尼给耶稣涂油的女人和前一次给他涂油的女人都是抹大拉的福音书。用神秘和隐晦的方式提到这个使徒和作者一贯明确的叙述风格相矛盾。因此，《约翰福音》在此之前很有可能明确说出过这个迷一般的使徒的身份。它是不是曾经说过耶稣特别喜爱哪一个使徒呢？答案是肯定的。事实上，它曾两次提到过这个人。
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