上皇是天皇的爹，他的旨意谁敢不遵呢?从此开始了日本的院政时代。上皇可以颁布院宣，否定天皇的旨意，上皇的院宣和天皇的诏旨具有同等的法律效力，日本从此就有了两处最高行政机构。
藤原赖通当然不高兴，但是他当时毕竟已经八十一岁高龄了，没有精力去阻止上皇的意图。所以，院政就顺利地推行了下来。可惜，开创院政的后三条天皇英年早逝，刚刚四十岁就病死了。他病死的时候，在别墅中静养的赖通正在吃饭，听说后三条上皇病死，赖通居然感觉非常可惜，叹息说：“本朝没有好运气，好不容易有了一位贤明君主，这么年轻就驾崩了。”
后三条天皇一门心思对付藤原氏一族，到他死的时候，藤原氏还为他感到叹息，可见后三条天皇心思缜密，无为而为，手段非常高明。
白河天皇继位之后，也就是前九年之役后过了二十年，日本的虾夷又出事了。当时统领当地的虾夷酋长清原真衡的弟弟清原清衡和清原家衡又发动了叛乱，朝廷又只好派源义家前去镇压。源义家历时三年总算平定了虾夷之乱，本来想进一步把虾夷彻底荡平，但是朝廷不肯用兵，不但不准他去追讨，不给报销军费，而且手下的武士打了胜仗也没有封赏。
源义家只好自认倒霉，变卖家产，赏赐下属。俗话说财聚人散，财散人聚，从此关东一带对于源家是死心塌地。宁可背叛朝廷，也绝不背叛源家，成为当时关东武士的口号。后来源家争夺天下，都是以关东为根据地。
2.天皇家的荒唐事儿
我是天皇他爹我怕谁
后三条天皇是日本院政制度的开创者，但是真正把院政发展成体系、发展出理论的是他的儿子——日本第七十二代白河天皇。
白河天皇继位的时候二十岁，父亲后三条上皇当时还健在，白河奉父命立自己的弟弟实仁亲王为东宫，后三条对自己的第三个儿子辅仁亲王期望更高，希望将来由辅仁亲王承继大统。但是白河可没有雅量，不像伯夷叔齐似的争相让位，更不像吴太伯似的三让天下。他不想让自己的三弟继位，当了天皇之后就熬着熬着熬着一直熬到十四年之后二弟东宫实仁亲王去世，二弟一死他马上立自己的儿子为东宫，同日他就退位内禅，让自己的病秧子儿子继位当了堀河天皇。
堀河天皇继位之后，白河就成了太上皇，把办公地点转移到了院厅，如果说天皇的办公室是朝廷的话，上皇的办公室就是院厅，这也是“院政”这个词的来历。
从行政办公的合法性来看，院厅是比不过朝廷的，但是白河上皇有恃无恐，我是天皇他爹我怕谁，天皇都得听我的，你们这些天皇的下属更得听我的。一直到第一百一十九代光格上皇于1840年驾崩为止，院政制度在日本持续了整整七百五十四年之久。也就是说，从白河天皇开始，日本的政体多了一个体制外的存在——上皇院政。
理论上说天皇是行政机构的中心，但他想干的事儿，只要关白反对就没法干，因为太政大臣、左大臣、右大臣、内大臣都是藤原氏的人，只要关白反对，大家就随声唱和，导致的直接后果就是天皇想干什么都干不了。但是上皇和天皇不一样，他是个体制外的存在，可以无视体制内以关白为首的朝廷群臣反对的声音，他的院宣可以代替天皇的诏敕。天皇的诏敕要经过大臣的合议才能发出去，这是一条原则，而上皇的院宣跟大臣们的意见没有任何直接的联系，上皇的周围有很多忠实的拥趸，对上皇的言行没有抵触感，院宣能够顺利地发出去，院政的运转系统比天皇的运转系统要灵便得多。
这样，白河上皇就成了治天之君。打那儿以后，日本的天皇凡是要掌握权力、摆脱摄关政治就必须得退位当上皇。在位掌不了权，退位才能掌权，这在世界君主制史上也是一个奇观。
白河上皇不但巩固了院政，他还创建了武装集团——上皇禁卫军——北面武士用来护卫院厅，后来这个武装集团就成为平家崛起的先遣部队。
把亲妹妹嫁给亲儿子
白河上皇虽然巩固了院政体制，夺回了皇家的权力，但他并不像他父皇那样能够选贤任能，励精图治，也不是一位有道之君。
他当了上皇以后，他的三弟辅仁亲王还在，而且辅仁亲王仪表堂堂，才学出众，天生就是一副帝王相，朝臣们称之为三宫。而白河自己的儿子堀河天皇继位的时候只有八岁，瘦小多病，一看就是早夭之相，一旦堀河驾崩，朝廷上上下下都希望三宫继位。
白河内心只想让自己的直系子孙持续皇统，对继位呼声很高的眼中钉、肉中刺三宫辅仁亲王是怎么看怎么不顺眼。再说了，病秧子也不是完全就没用了，他还能生孩子，给自己生个孙子，孙子继承皇位也是合乎情理的。为了早日得到孙子，白河竟然把自己三十多岁的亲妹妹笃子嫁给了十三岁的儿子，等于是侄子堀河天皇娶了自己的亲姑姑，这为日本皇室乱伦史又增添了浓墨重彩的一笔。
为什么要把妹妹嫁给儿子呢?按照白河的想法，成熟健康的妹妹更能给自己生孙子。问题是这完全不符合优生学，姑姑嫁给了侄子，虽然能体贴照料，但是乱伦之花结不出果来，等了好几年，妹子的肚子也不见动静。
儿子是眼瞅着一天不如一天，白河天皇只好到处去庙里祈祷，给儿子广纳妃嫔，好不容易终于有一位妃嫔生下了皇子，上皇抱着小孙子激动得泪流满面，说十年来朕朝夕盼望的事儿终于实现了。
生个儿子叫叔叔
孙子出生四年，体弱多病的堀河天皇就驾崩了，然后由上皇做主，四岁的小屁孩儿继位，这就是鸟羽天皇。
白河精打细算，成功地断绝了辅仁亲王继位的念想，但白河还是不放心辅仁亲王，索性找了个参与作乱的借口，把他囚禁，这样就为自己这一支承继天皇大统扫清了障碍。
白河上皇为了能够握住手中的权力，无所不用其极。他不但亲自安排儿子乱伦，自己更是以身作则，将日本皇室乱伦的传统继承、发扬、实践到了一个新的高度，竟然染指孙媳妇。就算日本皇室再富有乱伦的传统，但与自己的孙媳妇不干不净，也是令人发指的。
白河上皇自从皇后贤子英年早亡之后就开始胡来了，不放过任何一个身边的女人，到了晚年六十多岁的时候更是遇到了一位尤物——大纳言藤原公实的女儿藤原璋子。璋子是一代佳人，生性轻浮，上皇一见倾心，就把她拉入帷帐。但是年龄差距太大了，璋子比白河上皇小五十多岁。上皇不好意思把她纳入后宫为妃，只好先认作义女，等到孙子鸟羽天皇十六岁的时候，就把她嫁给了鸟羽做皇后。
但实际上鸟羽和璋子新婚之夜啥也没发生，替鸟羽当新郎的却是白河。到了第二年爷爷替孙子生了个儿子，白河是老来得子啊，这个实际的亲儿子、名义上的曾孙子简直就是他的心肝宝贝。鸟羽对此十分愤怒，孩子出生的时候，根本就没有去看望，当侍从向他禀报说皇后生子之时，鸟羽气愤地把头上的乌帽子扔在了地上，然后喊道：“非寡人之子!”并且他公开管皇后生的这个儿子叫“叔父子”，名义上是子，实际上是叔叔。
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