而在核查过程中发现，远华集团的每一笔进出口业务的文件都是非常规范的，不但有规范的外贸合同、销售合同、委托进出口批文，而且也有关税、检验等文书记录，应该说是“天衣无缝”，但为什么会有这么巨大的差额呢?
专案组为了弄清楚这个问题，立即就对厦门海关关长杨前线及涉嫌官员进行了监控。经过几个月的调查，终于在8月17日揭开谜底，远华集团进口的规范文件全部是与海关内外勾结伪造的，远华集团委托进口的东方、开元两家国营外贸大公司的公章、业务章早已掌握在远华人员的手中，他们想怎样制造文件就怎样制造。
8月19日上午，专案组从外地调集了300名武警官兵包围了厦门海关，从办公地点发现了大量假单证和瞒私放私的罪证。杨前线以及20多名涉嫌官员被羁押至金雁宾馆。
杨前线是一个“精明”过头的人，他多次制造假的缉私成绩，瞒天过海获得了全国优秀海关头衔。然而，在铁的罪证面前，他不得不交代与远华等勾结、受贿亿元的犯罪事实。杨前线的坦白是查处厦门惊天走私案的序幕。
8月21日，数百名武警官兵突袭远华集团，封锁了公司及其下属企业所有的办公楼、车间及专用于接待官员的红楼招待所，羁押了涉嫌走私和行贿的170多名骨干职员。
这个战果已经算是多年不见的了，但这个突袭最意想不到的是，在远华公司中搜查到了他们送礼行贿的花名册，福建、厦门数百名官员榜上有名。这个花名册是有来由的。
远华在厦门银行的账户全是空的，赖昌星将所有的银行贷款、走私销售款全部转移到了香港，需要用钱的时候，就派公司的财务总管和保镖去香港提取现金，押送至厦门。这位财务总管知道赖昌星不是好惹的，他一是为自己着想，而是为了对赖昌星有所交待，就私下将每位接受行贿送礼的官员的姓名、时间、金额和用途都作了详细记录，这本古今难得的“贪官受贿录”就这样产生了。
有了花名册在手，专案组向福建、厦门部门发出“双规通令”，要求所有的受贿官员在规定时间、地点坦白受贿事实，上缴受贿资金。大部分官员都在较短的时间接受双规，然而也有一些官员抱着侥幸的心理拒绝坦白交代，包括当时厦门的市委副书记刘丰、张思绪、公安局局长欧金祥、工商银行行长叶志成、商检局副局长罗良玉等人。
拒不交代的官员们相继被“请”进了金雁宾馆。随着调查和羁押人员的增加，专案组不得不急速“扩军”， 先后从全国各地召集500多名专案人员，专案组总人数到达了740多人，这是新中国成立以来最庞大的专案组。
专案组下榻在厦门的金雁宾馆、白鹭宾馆，一个宾馆已经装不下数量庞大的专案人员和涉案人员了。专案组在酒店的费用全部都是自理，每天需要20多万元的开销。曾经有段时间经费非常紧张，专案人员不得不将生活费由100元缩减为80元。厦门市的领导知道这件事之后，表示愿意在财政上给予补贴，但专案组的人没有同意，这显示了中央彻底查处厦门走私案的决心。
赖昌星是何许人也
走私案被揭发之后，很多人都疑惑，这个赖昌星是何许人，他有什么样的本领能营建一个如此庞大的走私网络呢?
专案组人员在询问被羁押的官员时，逐渐了解了有关赖昌星的一些生平。
赖昌星原籍福建晋江，1958年出生，因为身体发福，厦门人背地里都称他是“赖胖子”。他年轻的时候，曾经在晋江卖过破烂，因为他出手大方，为人义气，在晋江结识了不少朋友，其中包括当时当地的驻军长官。
20世纪70年代，赖昌星到了香港从商，大陆改革开放后，他以港商身份回晋江发展，受到了昔日结识朋友的支持，政府也对他比较支持，于是他担任了晋江市外商协会负责人及泉州同乡会负责人。
赖昌星是靠走私芯片起家的。1993年初，全国人大常委会的一位泉州籍副委员长出席了泉州同乡会，赖昌星借着这个机会结识了这位领导人，就像他的姓一样“赖”上他。通过这位领导人，赖昌星在北京开办了公司，并认识了另两位领导人及其子女。
不久之后，赖昌星从其中一位领导的儿子口中得知军队和国家急需大量电脑软件。他觉得这是一个发财的好机会，于是他就利用香港公司与某军工企业秘密进行电脑芯片贸易。这笔交易让赖昌星发了一笔横财，为他后来的发展积累了一定的原始资金。
1994年，赖昌星到了厦门，以1亿多港币注册了“厦门远华电子有限公司”，别看公司的名字上有“电子”两个字，但他不做任何电子产品，而是专门进行芯片的走私。
赖昌星尝到了走私的甜头，当然想把生意扩大，赚更多的钱，于是他逐渐涉足厦门的石油业、房地产业、文体娱乐业，远华电子有限公司迅速扩展为远华集团。
为了显示自己高一层的身份，赖昌星在办公室、招待所悬挂了他与某领导人的大幅合影，还频繁地邀请北京的高层人士到厦门，与此同时，还大手笔笼络省市官员。
1996年，赖昌星积累的资本已经非常雄厚，他决定要设计建造一座大厦，彰显自己的实力，同时也用于集团的办公。就这样，高达三十八层的远华国际中心在不久之后就破土动工了。
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